转让上海工程公司涉及到许多法律程序和文件，其中包括以下几个方面的协议：<

一、股权转让协议

股权转让协议是转让公司股权的法律文件，其中包括转让方、受让方、股权转让的数量和价格、交割条件、违约责任等内容。

首先，转让方需要向受让方提供公司的股权证明和相关法律文件。其次，协议中需要明确转让的股权比例以及受让方需要支付的转让价格。

此外，协议还应包括双方对于股权转让过程中可能出现的风险和责任的约定，以及转让完成后的交割和过户手续等。

股权转让协议的签署是转让公司所有权的重要法律手续，能够保障转让双方的权益和合法权利。

二、保密协议

在转让过程中，双方可能会涉及到公司的商业机密和重要信息，为保护这些信息的安全，需要签订保密协议。

保密协议主要约定了双方在转让过程中需要保密的信息范围、保密期限、保密义务、违约责任等内容。

双方在签署保密协议后，应当严格遵守协议约定，不得擅自泄露公司的商业机密，以确保转让过程的顺利进行。

三、资产转让协议

如果转让的是公司的部分资产，而不是股权，那么需要签订资产转让协议。

资产转让协议应当明确转让的资产种类、数量、价值、交割条件、过户手续等内容，同时约定双方的权利和义务。

在签署资产转让协议前，双方需要对转让的资产进行清查和评估，以确定其价值和转让条件。

四、债权债务清理协议

在转让公司所有权的同时，双方还需要对公司的债权债务进行清理，以确保转让后公司的债务责任得到妥善处理。

债权债务清理协议主要约定了转让方和受让方对于公司债务的清偿责任、清偿方式、清偿期限等内容。

双方在签署债权债务清理协议后，应当按照协议约定及时清偿公司的债务，以确保公司的信用和声誉。

综上所述，转让上海工程公司需要签订股权转让协议、保密协议、资产转让协议和债权债务清理协议等法律文件，以确保转让过程的合法性和顺利进行。